Doanh nghiệp nhỏ và vừa đăng ký kinh doanh lần đầu được miễn thuế thu nhập 3 năm

Chính phủ đã ban hành Nghị định 20/2026/NĐ-CP quy định chi tiết và hướng dẫn thi hành một số điều của Nghị quyết 198/2025/QH15. Một trong những nội dung đáng chú ý tại nghị định là miễn, giảm thuế thu nhập doanh nghiệp. 

Cụ thể, doanh nghiệp nhỏ và vừa đăng ký lần đầu sẽ được miễn thuế thu nhập doanh nghiệp 3 năm đầu kể từ ngày được cấp Giấy chứng nhận đăng ký lần đầu. Thời gian miễn thuế được tính liên tục từ năm đầu tiên được cấp giấy chứng nhận.

Trường hợp Giấy chứng nhận đăng ký doanh nghiệp được cấp trước thời điểm Nghị quyết số 198 có hiệu lực, nếu doanh nghiệp vẫn còn thời gian được hưởng ưu đãi thì tiếp tục được áp dụng ưu đãi cho thời gian còn lại theo quy định. Cần lưu ý, chính sách này không áp dụng với doanh nghiệp thành lập do chia, tách, sáp nhập, hợp nhất, chuyển đổi chủ sở hữu hoặc loại hình hoạt động.

Các công ty khởi nghiệp sáng tạo và tổ chức hỗ trợ khởi nghiệp được miễn thuế thu nhập 2 năm đầu và giảm 50% trong 4 năm tiếp theo. Doanh nghiệp phải hạch toán riêng thu nhập được ưu đãi hoặc phân bổ theo tỷ lệ doanh thu, chi phí.

Ngoài ra, doanh nghiệp cũng được miễn thuế với thu nhập từ chuyển nhượng cổ phần, phần vốn góp, quyền góp vốn vào doanh nghiệp khởi nghiệp sáng tạo. Cơ chế này không áp dụng với chuyển nhượng cổ phiếu của công ty đại chúng, doanh nghiệp niêm yết. Tương tự, trường hợp chuyển nhượng vốn gắn với bất động sản, họ phải thực hiện theo quy định thuế chuyển nhượng bất động sản.

Với thuế thu nhập cá nhân, Nghị định quy định miễn khoản này cho người có thu nhập từ chuyển nhượng cổ phần, phần vốn góp, quyền góp vốn, mua cổ phần vào doanh nghiệp khởi nghiệp sáng tạo.

Chuyên gia, nhà khoa học tại trung tâm nghiên cứu phát triển, startup, tổ chức trung gian hỗ trợ khởi nghiệp sáng tạo... được miễn thuế thu nhập cá nhân trong 2 năm đầu, giảm 50% với 4 năm tiếp theo với khoản thu từ tiền lương, tiền công.

Liên quan tới hỗ trợ nghiên cứu, phát triển ứng dụng công nghệ, Nghị định quy định doanh nghiệp được trích tối đa 20% thu nhập tính thuế thu nhập doanh nghiệp để lập Quỹ phát triển khoa học, công nghệ, đổi mới sáng tạo và chuyển đổi số. Doanh nghiệp được dùng quỹ này để tự triển khai hoặc đặt hàng nghiên cứu phát triển khoa học công nghệ, đổi mới sáng tạo.

Bên cạnh chính sách thuế, Nhà nước cũng hỗ trợ doanh nghiệp nhỏ, siêu nhỏ, hộ kinh doanh và cá nhân kinh doanh thông qua việc cung cấp miễn phí các nền tảng số và phần mềm kế toán dùng chung, góp phần giảm chi phí tuân thủ và thúc đẩy chuyển đổi số trong khu vực kinh tế tư nhân.

Nghị định cũng quy định rõ trong cùng một thời gian, nếu doanh nghiệp có đồng thời nhiều chính sách miễn, giảm thuế khác nhau, thì được lựa chọn chính sách có lợi nhất và phải thực hiện ổn định, không thay đổi trong suốt thời gian được miễn, giảm thuế.

Trường hợp trong kỳ tính thuế đầu tiên, doanh nghiệp có thời gian hoạt động sản xuất, kinh doanh được miễn, giảm thuế dưới 12 tháng, thì doanh nghiệp được lựa chọn áp dụng miễn, giảm thuế ngay trong kỳ đầu tiên hoặc đăng ký với cơ quan thuế để bắt đầu hưởng ưu đãi từ kỳ tính thuế tiếp theo.

Nghị định ký và đã có hiệu lực từ ngày 15/1. Tuy nhiên, các quy định nêu trên có hiệu lực từ ngày 17/5/2025, áp dụng từ kỳ tính thuế năm 2025.

Tính đến cuối 2025, cả nước có gần 1,1 triệu doanh nghiệp đang hoạt động. Theo Nghị quyết 68, Việt Nam phấn đấu đến 2030 có 2 triệu doanh nghiệp hoạt động. Khu vực kinh tế tư nhân tăng trưởng bình quân 10-12% một năm, cao hơn tốc độ tăng GDP. Đến 2030, Việt Nam có ít nhất 20 doanh nghiệp lớn tham gia chuỗi giá trị toàn cầu.